建文帝削藩，采纳了以兵部尚书齐泰、太常寺卿兼翰林学士黄子澄为首的武力削藩之策，过于刚猛激越，致使诸藩王被流放的，被迫自杀的，比比皆是，一时众多藩王人人自畏。这也给早就图谋大位的燕王朱棣以“清君侧”的口实，最终导致满盘皆输，城破隐遁的可悲结局。
回过头来看建文帝该不该削藩呢？其实早在朱允炆当皇太孙的时候，就对虎视眈眈的藩王叔叔保持着高度的警惕和担忧，他也曾经请教过老皇帝朱元璋，可没想到朱元璋却被这个难题彻底给难住了。祖孙俩尽管谈了一阵子，说什么“以德怀之，以礼制之”，但最后还是说到了要害——削地削藩，以兵讨之。朱元璋最终也肯定了皇太孙的主张，可以说，削藩是朱元璋的遗策，是被“祖上”所认可的，但前提是不能过于刚猛。
为了皇权的巩固，削藩是大势所趋，是建文帝一定要做的头等大事。问题是，到底该如何做，才是最稳健的办法。其实建文朝当时有不少大臣提出很多削藩之策，其中也不乏比较稳健的策略。
如在吏部任职的高巍认为，当前不能再用西汉晁错所用的武力削藩的方法，应该仿效西汉主父偃的“推恩”策略。他建议将北方诸藩王的子弟分封到南方，将南方诸藩王的子弟分封到北方去。如果能做到这样，那么藩王的权势不用你去削，他就自己减弱了。
然而在建文帝看来，高巍的建议虽然可行，但不适合当时大明帝国严峻的局势，高巍的方案真正实施起来要有较长一段时间，一旦“推恩令”下达，藩王们完全可以以儿子年龄小作为借口进行拖延。病急要用猛药，高巍开的方子太舒缓，不合口味，所以建文帝对此束之高阁，没有采纳。
而在这时，户部侍郎卓敬的削藩建议引起了建文帝的重视。因为他开出了一味不温不火且能解除急病的猛药方子。
卓敬（？-1402年），浙江瑞安人。明朝著名的才子，少时聪颖绝伦，博学多才，诗词宏丽，文章奇拔磊落。明洪武二十一年(1388)进士，廷对第二，被授户科给事中，品级与县令相当，但他的监察权力相当之广。卓敬秉性耿直，凡事他认为要讲的，从不考虑有没有什么忌讳或回避的，经常向皇帝直言进谏。洪武晚年，卓敬已经被提升为户部侍郎。朱元璋严禁江浙人出任户部官，这个卓敬能当上户部侍郎，大概是算皇帝老爷格外的开恩吧，可见卓敬这个人的才识非同一般，深得老皇帝朱元璋的喜爱。
到了建文朝，眼光敏锐、天性耿介的卓敬并没有因为自己官职没有提升而坐视不管国家大事。建文帝登基后就开始找他的几个心腹智囊密议削藩之事，但即使再保密也会流露风声，同在朝中上班的卓敬出于为国分忧的高度责任感，他给建文帝上疏，提出了将“群龙之首”藩王中实力最强的燕王迁徙到南昌去的稳健削藩之策。
卓敬说：“燕王智虑绝伦，雄才大略，酷似高皇帝朱元璋。现在他盘踞于藩地北平，北平地势险要，兵马强壮，燕王府原本又是辽金元的皇宫，墙高院深，这种局势已经相当危险啊。当今皇上您就应该将他迁徙到南昌去，燕王一迁徙，问题就容易解决了；万一他要是作乱，朝廷也就容易控制住他了。世上有这样的事情，将要萌发而没有显现动静的，这叫征兆；等到适当的时间可以做而做了，叫时机。时机没到很成熟的时候，往往一般人没法判断，征兆没到了明显的时候，是不被人们所觉察到的。”
建文帝读到卓敬的奏疏以后，吓得一身的冷汗，他知道诸王当中最难对付的就是老四朱棣，说起他就要头大，卓敬现在直接提到要修理他，可把生性文弱的建文帝难坏了，他连忙将卓敬的奏疏装入袖中，呆坐了好一会儿，然后才回到后宫里去。
第二天，建文帝急忙召见卓敬，君臣之间就削藩问题交换了意见，卓敬叩首说：“臣所说的是天下的至计良策，恳请陛下明察！”但最终建文帝也没有采纳卓敬的建议。
从卓敬所提的削藩主张来看，确实比较符合当时的实际。既然当时人们都意识到了藩王之中危险与祸害最大的是燕王朱棣，从他身上下手是最为恰当的，打蛇打七寸，擒贼先擒王。而且手段也很巧妙，将燕王从北方迁徙到南方，既维护了“亲亲”之义，不伤“情面”，又把朱棣挪了个窝，让他到新地方，一下子造不起反来，这不失为当时的一种最佳的选择。
当时多数人并没有意识到卓敬之策的威力，就连一直自许类于皇父朱元璋、具有雄才大略的朱棣也一直被这样的方案蒙在了鼓里。“靖难之役”后，朱棣大杀建文朝臣，唯独他想对卓敬网开一面。朱棣曾跟他的军师姚广孝说：“建文朝的奸臣都想害我，唯独卓敬还算不错，他奏请将我徙封到南昌去，我觉得他尚可宽恕。”
但姚广孝因为过去跟卓敬有过节，就点出了卓敬之策的厉害之处：“陛下您看走眼了，南昌地处下游，一旦南京发兵往南昌，其势就如囊中取物，要是当年建文帝采纳了卓敬的方案，陛下哪有今天之天下啊！”最后卓敬被斩杀，夷灭三族。
那么既然卓敬的方案这么好，为什么建文帝没有采纳？
这里就涉及到一个政治家的胆识问题，严格意义上来说，建文帝个性文弱，甚至可以说是懦弱、怕事，绝对不是阴险而又有军事才能和威望的四皇叔朱棣的对手。他对燕王朱棣有着说不清道不明的恐惧，也许心里嘀咕，万一迁徙燕王他不走，就地造反，那可怎么办？
做大事就怕这样前怕狼后怕虎。建文帝自己心里没谱，削藩的事宜就全交给了他眼中的两个红人——齐泰、黄子澄了，所以卓敬的方案也只能弃之不用了。
所以说，有没有好的建议是一回事，采纳不采纳则是另外一回事，往往更为重要。对于建文帝削藩之失策，人们议论很多，颇感遗憾。其实当初建文帝更信任齐泰、黄子澄，他惑于齐、黄等人之策也是必然，后世再多遗憾也只是事后诸葛而已。