随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。
讲师团队
北京基因组所于军教授、胡松年教授为您讲授基因组学基础知识和前沿进展、基因转录组的测定及分析、二代测序等实验技术的关键事项;
浙江大学杨军教授、陈铭教授等讲解系统生物学及高通量分析研究方法和思路。
开课时间及地址
时间:2017 年 8 月 18 日~8 月 25 日
(备注:18 日为全天报到日,19 日开始上课)
地址:杭州浙江大学华家池校区
研习班多次获得浙江大学优秀项目创新奖,目前已举办 51 期,学员来自全国 30 余个省市,累计培训学员 5 100 余名。参与人员不乏教授、博导参加,更受到博士后、硕博生等年轻学者的青睐。
学员通过本研习班建立了长期协作关系,共同申请国家 973、863 课题,共同发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在 SCI 期刊上发表。
培训结束,发放浙江大学继续教育证书。
培训内容
上课内容涵盖「基因组学—蛋白质组学—系统生物学」的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。
1. 基因组的比较研究、DNA 测序技术原理与进展(讲课人:于军教授)
2. 转录组的测定与分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学、基因组学与精准医学(讲课人:胡松年教授)
3. 系统生物学建模分析及高通量分析技术应用(讲课人:杨军、陈铭教授等)
4. 蛋白质组学概论及应用(讲课人:钟伯雄教授)
上机学习内容
上机实习课采用 「跟我学」方式,学习实践各类基础生物信息学软件,每人一台 PC 机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。
实习一: 基因组数据注释和功能分析
通过序列比对工具 BLAST 的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具 ClustalX 及分子进化分析软件 MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能;学习基因序列分析常用的数据库和软件。
实习二: 转录组数据分析
介绍转录组数据分析的基本流程及其原理;通过对 tophat、cufflinks、R 等转录组数据分析工具的介绍及演示,了解基于二代测序数据的转录组分析流程及常用分析方法; 利用 kegg、GOstat、DAVID 等在线工具挖掘转录组数据的生物学意义。
实习三:系统生物学软件实习——网络结构显示与分析
利用 Cytoscape 系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
实习四:蛋白质结构与功能分析
从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
实习五: 蛋白质组质谱分析
使用 X!Tandem、Mascot、Sequest 等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用 TPP 软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
收费标准
注册费为 3 800 元/人(可转账、现金、刷卡【含公务卡】)。
食宿可统一安排,费用自理。
联系我们
联 系 人:代成林
联系电话:
18757558672
0571-88206579
邮箱:
genetrain@zju.edu.cn
daichenglin@zju.edu.cn
文章来源:浙大纳米院
图片来源:浙大纳米院
题图来源:shutterstock.com 正版图库
↓↓↓