本讲的相关配置
· 操作系统和配色方案:WIN7 Home Basic
· 屏幕分辨率:1024×768
· 数据处理软件
- Microsoft OfficeExcel 2010
- IBM SPSSStatistics 19【可计算IC50】
- GraphPad Prism 5【可计算IC50,本讲推荐】
- Origin8.5.1
任务:绘制量效曲线,计算IC50
IC50:半数抑制浓度(对应左图),Y轴的研究指标随浓度递减。
EC50:半数有效浓度(对应右图),Y轴的研究指标随浓度递增。
右图其实是把Cell Inhibition当成药物的效应,与药物浓度呈正相关。
其实对于细胞毒实验,两者是相等的。
如果药物有抑制细胞活性的作用,习惯上称之为IC50(称呼而已)。
【实例操作1】细胞毒实验计算IC50
· 细胞毒实验:SRB法,MTT法
· 阴性对照组Concrol:给药浓度为0的含细胞的孔,实验中以该组细胞活力当成100%。
· 空白组Blank:无细胞的孔,用于吸光度的调零(扣掉96孔板自身的一点儿吸光度)。
拓展知识:计算IC50的其他方法
方法1:前面已演示,用Excel计算Mean,SD和N,转换成百分数后用GraphPad计算。注意选择normalized Response-Variable slope。
方法2:XY→Use sample data→Dose response,直接将吸光度值输入GraphPad近似计算。选择response-Variable slope。【快速,但有近似,有主观成分】
方法3:使用SPSS,分析→回归→Probit。
方法4:使用Excel,对中间呈线性的几个点进行线性拟合,用线性方程来近似计算。【简易,但有近似,有主观成分】
未
完
待
续
浩然专栏
张浩然,男,北京大学药学博士,创作了被广为传播的课程《科研实用电脑技巧四部曲》,内容涉及科研工作者的实用电脑技巧及相关软件。等不及想看四部曲?给我们发送H002,打包给你哦。
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